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As intervenções biológicas atuam no equilíbrio biológico do sistema oral: modificam a microbiota, a resposta imunológica ou os processos de regeneração tecidual. Os principais são: antibioticoterapia (amoxicilina/metronidazol em periodontites agressivas), terapia probiótica (Lactobacillus reuteri, L. salivarius para competir com S. mutans e patógenos periodontais), terapia fotodinâmica (luz laser + fotossensibilizador que gera oxigênio singlete bactericida), agentes biológicos antiinflamatórios (inibidores de IL-1, antagonistas de RANKL como denosumab para interromper a reabsorção óssea periodontal) e regeneração óssea guiada (barreira). membranas com ou sem enxertos ósseos para regenerar osso alveolar perdido). A cinética de eliminação bacteriana pelos antibióticos segue modelos de primeira ou segunda ordem, dependendo se são dependentes da concentração (quinolonas, metronidazol) ou dependentes do tempo (penicilinas). A terapia fotodinâmica segue a lei de Bunsen-Roscoe: o efeito bactericida é proporcional ao produto da irradiância pelo tempo de exposição (dose de luz).

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