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Les interventions biologiques agissent sur l'équilibre biologique du système buccal : elles modifient le microbiote, la réponse immunitaire ou les processus de régénération tissulaire. Les principaux sont : l'antibiothérapie (amoxicilline/métronidazole dans les parodontites agressives), la thérapie probiotique (Lactobacillus reuteri, L. salivarius pour rivaliser avec S. mutans et les pathogènes parodontaux), la thérapie photodynamique (lumière laser + photosensibilisateur qui génère de l'oxygène singulet bactéricide), les agents biologiques anti-inflammatoires (inhibiteurs de l'IL-1, antagonistes de RANKL comme le denosumab pour stopper la résorption osseuse parodontale) et les thérapies guidées. régénération osseuse (membranes barrières avec ou sans greffes osseuses pour régénérer l'os alvéolaire perdu). Les cinétiques d'élimination bactérienne par les antibiotiques suivent des modèles du premier ou du second ordre selon qu'elles sont concentration-dépendantes (quinolones, métronidazole) ou temporelles (pénicillines). La thérapie photodynamique suit la loi de Bunsen-Roscoe : l'effet bactéricide est proportionnel au produit de l'irradiance par le temps d'exposition (dose de lumière).

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